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菲兹冰冻睡眠74年 神盾特工局需要新鲜力量　　神盾局特工一直都在试图拯救人类，可是他们发现似乎越努力，越会事与愿违。菲兹遭遇意外，为了避免他死去，只能先被冰冻睡眠，在外太空游走着….一年后，戴维斯驾驶飞船，带着伙伴们逃脱敌人追击，却误入了德瑞林的领地，这已经违反了银河条例。为此，他们必须接受登船检查。黛西走到船舱外接受检查，为首的人态度十分不逊，她就小施技巧教训了这个人，还挖出了可追踪燃料的线索。　　在地面上，麦克为首的神盾特工组织在追查一个无名者的行踪。他派出了梅，但还是铩羽而归。麦克很焦虑，只能看着科尔森局长的影响缓解心情。他希望梅多招募一些聪明的人进来，尽快完成任务。梅很尽责的带来了马库斯博士，一所大学的教授。麦克和这位教授找到了感情上的共鸣，为了死去的知交好友，他们必须继续努力下去，重建神盾特工学院。　　黛西和同伴们一直在寻找菲兹所在的飞船，这次在德瑞林找到的线索，发现了一半的飞船遗骸。里面没有尸体，却也代表着不妙的情况。这种情况让戴维斯和西蒙产生了动摇，他们思考是否要回去地球，与大家重聚。就在这时，西蒙躺进了菲兹曾经睡眠的冷冻舱里，泪水朦胧中她看到了内壁上有两行小字。上面写明了冷冻舱的产地是那罗阿契亚，一颗行星，或许菲兹会去那里想办法去重新冷冻自己。　　西蒙想要去这颗行星，但是黛西和戴维斯这些朋友十分反对，因为这所飞船需要回去寻找供给才能继续去往深空。正在大家争执的时候，联盟的驱逐舰从上方经过，随时可能发现他们。驱逐舰发射出许多炮弹，戴维斯必须带着大家跳跃回到地球了。而西蒙斯却做了相反的选择…　　有一个疑犯在穿越墙壁时被冻结，梅和马库斯正在研究他，发现他的怀里有一个表，上面写出了时间和坐标。麦克很快判断出，这是他们追踪的那伙人的下次行动地点。凯勒、福斯特、梅和悠悠很快行动，包围了嫌犯。但是一场爆炸还是发生了，巨大的冲击阻断了通讯信号。梅和伙伴们只能眼睁睁看着嫌犯逃走，却无能为力。　　在另一个星球上，菲兹似乎复活了，而且伪装成外星人的样子正常生活着。$$$萨吉变成了假科尔森 菲兹救下了飞船上的人　　爆炸的浓烟里，梅似乎看到了科尔森的身影，但是她觉得那一定不是真的，科尔森在她的脑海里已经深深的扎了根，他的背影刺疼了她的眼她的心。新的科尔森也就是萨吉，他带着他的同伙捷科、帕克斯和雪花袭击了一个超市，然后驾车离开，瞬间卡车就神奇的消失在了墙的外面。科尔森死后，迈克接替了新的神盾特工局局长，他正在向梅和悠悠球安排工作，要她们分头去继续寻找萨吉他们的线索。　　而梅单独留下来希望迈克听取自己的意见，从卡车查起，迈克说她看到的可能真是科尔森，他需要更多的证据，所以卡车的线索暂时留着。因为福克斯的死，让凯勒十分难过，他们是同乡，也是凯勒介绍他来到神盾特工局的。梅过来安慰他，凯勒表示感谢。　　此时，萨吉他们已经来到了一个货场，结果发现他们的压电宝石（PEG）没有了，这是一种能够产生电力动能的特殊水晶，对于他们来说特别重要，必须想办法再进行补充。萨吉和帕克斯出来查看地形的时候，被货场的保安发现，萨吉放了一个烟雾弹掩护着两个人撤离了。　　迈克接到警情得知假的科尔森袭击了俄亥俄州的一个超市，特工队员们从超市里收集到了萨吉他们留下的踪迹，马库斯博士对他们留下的痕迹进行研究，结果表明，这个神秘人是一种新的生物，借助了高科技力量存活着，也可以理解为生化机器人，但是他身上的DNA又确实与死去的科尔森有着高度的相似之处，这个发现让梅十分惊愕。　　在辛辛那提的货场里又发现了萨吉的踪迹，迈克急忙安排梅和悠悠来到货场，可惜她们什么也没发现。梅走后，马库斯博士询问迈克梅为什么对科尔森那么关注，迈克告诉他，他们之间有着难忘的生死情结，而梅目前痛恨的是，那个长着和科尔森一样的脸的家伙却到处杀人。　　飞船继续在太空中行驶着，菲兹已经隐藏了自己 的身份，成为这条太空飞船上一名能干的工程师。但是，他看到这些长生人用来当做食物的山达尔蜗牛时，却抑制不住的恶心，结果被长生人发现了他的身份。正要被他们扔出船舱时，菲兹急忙申诉自己在船上的重要性，所有的机具部件都是他修好的，长生人头目也不否认他确实比他的手下干活利索，于是，就命令他在到达下一个目的地前要修好破损的防护罩，否则就处理掉他。看着干活麻利一个顶俩的菲兹，长生人头目准备杀掉他自己那些手下来减轻负担，只留下能干活的菲兹。菲兹不会看到那些人因为自己而送死，就和同样被囚禁在这里的依诺克一起，想办法除掉了头目，救下了全船的人。　　珠宝店里，女营业员迎来了萨吉一伙，让她把最贵的宝石拿出来，女营业员以为来了大买卖，正在高兴的时候，两个保安已经被杀人成性的雪花杀死。女营业员被胁迫着带萨吉他们来到了保险库，萨吉用尖端的高科技矛枪在墙上画出一个门的形状，轻易的打开了两米多厚的墙体，他们找到了压电宝石，准备从打开的墙门里出去。　　而接到报警的梅和悠悠他们此时也来到了珠宝店的保险库门外，保险库的门已经无法打开了，梅转到货场，发现了萨吉他们歇息的老巢，从里面进入了保险库，救出了女营业员，和萨吉的手下打成一片，只可惜她势单力孤，最终还是被萨吉一伙从墙门里扔了出来，墙门随即合上，半点痕迹也没留下。$$$菲兹和依诺克被驱逐 西蒙斯见到了菲兹　　黛西和戴维斯陪着珍玛.西蒙斯来到菲兹可能生活过的星球上，继续寻找菲兹。她们来到了星球的海关处，一个胖胖的检查员让她们交出武器接受检查，并说出来到这里的理由。当她们出示了菲兹的照片时，却被告知菲兹和他的光头朋友已经被这个星球通缉了，罪名是破坏星球。而西蒙斯听到了菲兹还活着的消息十分兴奋，但是现在的情况是，来拿这个星球的守卫者也都在找他。　　此时，菲兹和依诺克的处境非常不妙，菲兹和依诺克冒着生命危险救下了长生人船员，结果他们却恩将仇报，趁菲兹他们不备抢劫了飞船，把菲兹和依诺克赶了下去，无处可去的菲兹和依诺克无意中来到了基特森星球，在太空中，基特森星球臭名昭著，名声非常糟糕，而星球上遍布赌场和妓院，集聚了很多腐败官吏和江洋大盗，为了想办法离开这里，菲兹和依诺克唯一的办法就是筹到经费。于是，他们来到了赌场。　　黛西和西蒙斯她们终于找到了那搜太空飞船，可惜船上只剩下长生人了，在西蒙斯和黛西的逼问下，这些船员承认了自己恩将仇报把菲兹赶下船去的事实，但是却说不出来他们到底去了哪里。黛西和西蒙斯处理了那些船员，和戴维斯一起继续寻找，临走时，他们三人吃了长生人的圆饼点心，因为味道不错，戴维斯一下子吃了六个。他们找到了那个胖胖的检查员，听他介绍最近的就是名声糟糕的基特森星球，西蒙斯和黛西决定去那里碰碰运气。　　依诺克强大的大脑应付小小的赌局实在是大材小用，他轻松的赢了很多局，被赌场的管理带到了更高级别的赌局上，而这一次，菲兹竟然作为赌资被暂时抵押了。西蒙斯和黛西找到了基特森星球，她们在初级的赌场了没有见到菲兹，西蒙斯怨恨的说，他最好是死了也比自己在妓院里见到他强。就在这时，两个人忽然身子发麻，有些飘飘然起来，而且眼睛里出现了幻觉，控制不住的想笑，恍惚间她们倒在桌子底下，竟然忘记了这次来的任务。　　依诺克的运气这次没有那么好了，他输得很彻底，和菲兹两个人被囚禁在一间密室里等待惩罚。菲兹经过挣扎挣脱了束缚自己的绳索，依诺克却信心全无的颓废不已。菲兹鼓励他勇敢点，因为他是自己最好的朋友。他们必须共同努力一起想办法；离开这里。黛西和西蒙斯的药劲过了，重新抖擞精神对付着这里奇形怪状的对手。而一下子吃了六块圆饼的戴维斯也是浑身酸软，任由长生人将他拖到了角落里。打退了一层又一层基特森先生的卫兵，西蒙斯和黛西终于来到了菲兹关押的地方，而重新振作的依诺克和菲兹也由里向外打开了密室的门。当西蒙斯和菲兹相见的那一刻，两个人激动的忘记了危险，菲兹身后的警卫迅速的拖走了菲兹，眨眼间西蒙斯就再也看不到菲兹的身影了。$$$迪克被假科尔森追杀 凯勒体内飞进一只外星鸟　　游戏玩家迪克自从摽窃了神盾局的外太空科技元素之后，就开办了自己的创业公司，并且和朋友可汗一起将游戏公司做的风生水起，这天，他刚刚将自己的游戏又重新晋升到了一个全新的系统，准备因此投入批量生产而大赚一笔。这时，他的网红女朋友珂西娅来到他的公司找他去和波霸奶茶，顺便为他录制了一段视频发到网上，迪克对着镜头侃侃而谈，他说将来会出现一种食物供给人类，让所有的人都不再挨饿，轻而易举的生存下来，女朋友柯西娅对他的才能和理想非常欣赏。　　假科尔森和他的同伴们依然不停的寻求着行动的目标，看似平淡无奇的西姆特不幸的成为了他们的目标，但是，他在被假科尔森一伙杀害后，尸体出现了非常奇怪的症状。杀死了西姆特，假科尔森们马上就去寻找下一位行动目标，他们来到了迪克的游戏创业公司。正在对着镜头直播的迪克被秘书打断，她告诉迪克，有一位客户在办公室等他。于是，迪克让女朋友柯西娅自己去买波霸奶茶，自己去往办公室谈生意。　　迪克来到办公室，看到假科尔森后心情顿时紧张起来，他以为科尔森又重新复活这次是来找他算账的，因为他目前的游戏技术完全是剽窃了神盾局的技术，而他之所以成为假科尔森的行动目标，也是检测到他这里的信号与别处不同。迪克解释着自己剽窃的行为，可是假科尔森却看似没有听懂，迪克以为他的记忆已经在上次重伤后失去了。假科尔森打断了迪克喋喋不休的讲述，准备朝他动手。迪克利用熟悉的地形躲过了他的追杀，并且在可汗的掩护下逃了出来，原来，可汗正是神盾局派来监控迪克的特工之一。　　可汗向迈克汇报后，迈克带着直升机来救援他们，迪克告诉他们大楼里面一个人非常像科尔森，迈克和梅立即带人冲进了大楼。神盾局接到报警，说一位名叫西姆特的人被杀死在街头，留守的凯勒和悠悠帮助博士对那具尸体进行了解剖，没想到尸体里面竟然飞出了一只外星鸟，这只怪异的鸟到处横冲直闯，凯勒和悠悠到处寻找准备抓住它，不料这只鸟竟然飞进了凯勒的体内，凯勒马上就表现出了强烈的不适，博士准备施行手术帮他取出了，没想到凯勒的身体已经发出了非常炽热的高温，然后迅速发生了变异，从他的身体各个部位都长出了锋利的机械长矛，直接穿透了凯勒的身体将他死死的钉在了墙上。目睹了这一切，悠悠痛苦万分。　　迈克和梅冲进了迪克的办公楼，与假科尔森的同伙打斗在一起。迪克的女朋友买回奶茶后不知就里回到办公楼去找迪克，找不到后就给迪克打电话。担心柯西娅的安危，迪克再一次进入大楼。迈克正在与假科尔森的同伙搏斗，眼看占了下风，正好遇到迪克和女朋友，迪克将对方引入了游戏系统迷幻了他，自己则带着迈克脱离了危险。而梅的情形则不容乐观，她遇到了杀人成性的雪花，虽然战胜了她却落入了假科尔森的手里，他们劫持了梅之后，就开车离开了这里。$$$梅特工抓到了萨吉 黛西和迈克团聚　　梅特工梦到她和科尔森在阳光明媚的海岛上度假的情形，两个人温馨而且甜蜜，梅的嘴角不禁露出了一丝笑意。她猛地醒来，发现自己被绑住了双手正在一辆行进的卡车上，旁边就是假科尔森萨吉，而雪花则在前面驾驶着卡车行进。原来是萨吉让她喝了迷药才让她一直昏睡着的。到了目的地，雪花被萨吉指使去抓人，萨吉的两个手下在之前和神盾局的交手中都死于非命，现在，他的手下就只有这个杀人嗜命的雪花了。密室里只剩下了萨吉和梅，两人的共同话题就是科尔森，萨吉诋毁科尔森冒充自己，梅强烈的反驳说他才是真正的冒牌货。科尔森正直，勇敢，根本不像他一样这么邪恶，萨吉被激起了心中的怒火，他拿着刀子想要教训梅。　　菲兹被长生人中的猎人抓走了，西蒙斯他们继续寻找。而伊诺克因为失去了菲兹这样的好朋友而情绪低落，西蒙斯和黛西都耐心的安慰他。这时，飞船发生了猛烈的晃动。他们判断是联盟的人袭击了他们，于是便紧闭舱门随时准备战斗，只有伊诺克经过判断分析后，感觉情况不对，他依然打开了舱门，随着一团雾气升腾，一位女人走了进来，原来是长生人阿塔拉，她曾是伊诺克的上级，所以伊诺克才能感觉到来人似曾相识。阿拉塔告诉他们，长生人赖以生存的长生星球不存在了，毁灭于一场瘟疫过后的结构扭曲，加上联盟的入侵，他们虽然战胜了联盟，可是家园却不复存在了。　　博士还在继续研究凯勒身上出现的怪异的尖刺，上次凯勒发生了那样的情况后，如果不是悠悠果断的用刺刀杀死凯勒，博士和她都会被变异的凯勒所伤。但是亲手杀死了凯勒，悠悠心里十分难过，博士为了开导她，讲述了自己也拔过一个危重病人的呼吸机的往事，告诉她，每个人都会面临十分艰难的抉择，尽管那种选择是正确的。迈克询问博士的研究成果，博士感到压力巨大，他到现在还对这种外星寄生鸟一无所知，只知道这种能出现怪异晶体结构的新型寄生虫，会在旧的宿主死后，再去寻找新的宿主，所以自己准备去南美一趟，到神盾局发现第一块时间巨石的地方探寻。为此，他要求迈克为自己拍一架直升机。　　雪花抓回了一个强壮的男人，并且把梅带到了那个男人身边，萨吉放下一个刀子，说让梅杀了他，梅不答应，萨吉说她会按照自己的要求这样做的，这是转化梅的开始，因为他需要新的手下，而梅就是最好的选择。等萨吉和雪花出去后，梅就和那个男人被关在一间密室里。梅迅速拿刀子打开了自己的手扣，但是那男人却猝不及防的向梅袭击，梅急忙躲开，没想到男人瞬间身上长满了各种尖锐的水晶刺状物品，和凯勒身上的症状一模一样。原来这个男人也被植入了外星寄生鸟，满身尖刺的男人再一次疯狂的扑向了梅，为了防止被他伤害，梅只得用匕首结果了他。而萨吉和雪花在远程监控中已经看到了这一切，他们志得意满的打开了房门，嘴里说着欢迎梅加入他们的话语。　　阿拉塔坚持杀死菲兹，并要黛西和西蒙斯说出他们是如何跨越时间找到另一个星球的办法，但是，代谢和西蒙斯说不放了菲兹，他们就是敌人，要和阿塔拉斗争到底。伊诺克为了平息这场一触即发的战争，就告诉阿塔拉，只有菲兹才能研制出时穿的办法，而西蒙斯就是菲兹的动力源泉，他让阿塔拉放了其他人，自己去做菲兹的工作。黛西不愿意丢下西蒙斯，西蒙斯也觉得这是一个最好的办法，她留下让黛西和戴维斯回到地球，眼含泪水的西蒙斯感谢黛西和戴维斯的一路陪伴，她说自己还有菲兹，无论如何他们都不会分离。　　萨吉开着卡车继续行进，他和雪花放松了对梅的看管，梅趁机在后仓里解决了雪花，又突然勒住了正在开车的萨吉的脖子，两个人在狭小的车仓里展开了殊死的搏斗，万千愤恨集中在梅的内心，她爆发出来的仇恨和勇气使她最终将萨吉这个杀人狂魔制服，她将打晕了的萨吉用手扣扣在车厢里，自己驾车赶回神盾局。监控中心受到和风一号可以降落的信息，劝他警员欢声雷动。这时，舱门打开，消失已久的黛西和戴维斯出现在大家面前。大家欣喜的互相拥抱，问到西蒙斯和菲兹时，黛西他们一时无语。这时，有人报告，梅特工已经抓到了那个人正在赶回的路上。$$$菲兹与西蒙斯互相折磨 伊诺克违背上级救助二人　　菲兹以篡改地球的罪名被长生人抓进太空监狱。伊诺克为了使他免于被杀，将西蒙斯留下来和菲兹团聚，但是前提是菲兹必须为长生人找到时光穿越的办法。菲兹听说伊诺克把西蒙斯留下后气愤不已，他最担心的就是西蒙斯的安全。但是事已至此，没有比这更好的办法，所以，伊诺克不顾他的反对，将西蒙斯和菲兹关到了一起。两人经过了长长的光年之后，重新相见，激动之情无以复加，他们紧紧的抱在一起，发誓再也不分离了。他们知道阿塔拉不会就这样让他们轻松的待在一起 所以就抓紧时间尽情享受着这难得的幸福时光，两人诉说着分别后各自发生的事情，但是西蒙斯对菲兹之前的事却讳莫如深不愿提及，这让菲兹不由得有些疑惑。　　这时，阿塔拉突然出现，她要求菲兹尽快按照她的要求研制出时光穿越的方法，为此她愿意提供长生人最先进的研究成果为他所用，而菲兹知道研制这样的办法是违背科学规律的，他不愿意违背原则的受阿塔拉的驱使。菲兹的态度惹恼了喜怒无常的阿塔拉，她马上启动了对菲兹和西蒙斯的惩罚机制。菲兹正沉浸在和西蒙斯重逢的喜悦中时，忽然发现那个温柔漂亮的成年西蒙斯不见了，替而代之的是只有7岁半的西蒙斯，两个人因为存在年龄的巨大差异，对事物的讲解和看法截然不同，所以经常发生激烈的争吵，这让菲兹十分头疼，好在他和西蒙斯知道这是阿塔拉的诡计，两人竭力的战胜了彼此，恢复了和谐共处的局面。　　而对他们的情况了如职掌的阿塔拉见一计不成再生一计，她启动程序将两个人的记忆切换到了最初的时光，以期引起他们痛苦的回忆。时间切换到了他们大学毕业的时候，两个青葱少年都是天才，权威机构发现西蒙斯和菲兹的大脑有着惊人的相似，他们相互配合研发了许多尖端的发明创造，因此，被推荐到神盾局做外勤，就在那时，他们见到了他们的局长大名鼎鼎的科尔森。从此之后，他们珠联璧合完成了很多难以想象的任务，解救了无数限于困境的人们，两人也建立了生死与共的感情。就在最后一次任务中，菲兹发生了意外，陷入了脑死亡。当时的西蒙斯完全不能接受菲兹已经死去的事实，她天天痛苦的守在菲兹的床前不能自拔，所以她才不愿意去回忆那一段不堪回首的日子。　　菲兹穿越回去看到了自己在地球死了之后，西蒙斯和战友们为了自己痛不欲生的情形，那种痛苦的场面让他感到窒息。但这种痛苦想撼动两个神盾局的钢铁战士，似乎是阿塔拉想多了，她看到这样的回忆并未使两人屈服，就变本加厉的做出了更为疯狂的试验，她命人将菲兹和西蒙斯分别困在舱室里，将菲兹和西蒙斯人性丑恶，凶狠的一面释放出来，去攻击彼此，西蒙斯的另一面疯狂而恐怖，每次都想至菲兹与死地，她甚至将菲兹的胸腔打开，挖出了他活蹦乱跳的心脏，还说那是属于她的。而西蒙斯的处境也好不到哪里去，菲兹的邪恶面要用器械敲碎她的颅骨，刺耳的声音让西蒙斯几近崩溃。听着两个人惨不忍睹的惨叫，伊诺克无法忍受，他向阿塔拉建议，这样折磨两个人于事无补，很容易使他们情绪失控变成疯子。　　阿塔拉讽刺伊诺克现在变得心软了，伊诺克觉得自己变得越来越好了。阿塔拉冷冰冰的警告伊诺克，再这样敌我不分，就会将他肢解。实验室里，两个人被释放后，被关在一个狭小的密室里，他们为了自己刚才受到自己最亲爱的人那样非人的折磨而恼羞成怒，互相指责对方无情和恶毒，并把对方的每一次对不起自己的事情都大声的喊出来，完全没有了包容和爱护，语言攻击和谩骂声吵的他们精疲力尽。这时，一切忽然结束了，伊诺克将毫无人性的阿塔拉和她的手下，全部击倒，将菲兹和西蒙斯解救了出来。$$$菲兹和西蒙斯即将返回地球 迈克为救队员不得不答应萨吉条件　　依诺克不惜背叛自己的上级阿塔拉救出了菲兹和西蒙斯。但是他却误操作了时光按钮，结果几个人一起又被传送至基特森星球，而在这里，依诺克和菲兹都还是通缉犯。很快，基特森的手下就找到了他们，并将他们带着来到基特森先生的面前。这个基特森是第一代基特森的孙子，是他的爷爷当初来到这个星球，白手起家从第一间妓院和赌场建起，才有了今天基特森这样一个赌场和妓院云集的帝国。基特森准备那这几个地球人做一个游戏，吸引大家前来投注，而赌注就是他们的项上人头。依诺克作为合成人，这个游戏显然对他不起作用，所以，依诺克被排除在外。　　陪着他们做这个游戏的，是一个偷窃基特森星球财产的惯犯，游戏的方法是将菲兹，西蒙斯和那个惯犯一起绑住，在他们的脖子上方，分别坠有一个锋利的钢刀，如果三人没有足够的力量，那么钢刀落下来就正好切掉他们的脑袋，由于过于血腥，所以这个游戏引起了观众的狂热追捧，菲兹和西蒙斯的性命就这样命悬一线了。　　梅特工将萨吉和雪花带回了神盾局总部，但是他们拒不配合，迈克他们也只能从梅了解的情况中得知，萨吉已经有100多岁了，他们制造了尖叫鸟，也就是飞入凯勒体内的那种可怕的生物，这种鸟只要找到宿主，就会吸收宿主身上是能量和养分，迅速变成恐怖的各种尖刺，穿破周围的一切，而这种寄生鸟，萨吉他们在外面不知放了有多少。萨吉不开口，悠悠就来找之前抓到的捷科审问，可是他是萨吉忠实的手下，宁愿发着高烧也不愿意接受治疗，更不会说出半点有用的信息。　　神盾局接到警情报告，说两个寄生的尖叫鸟目标出现了，梅带着悠悠和其他特工一起去抓他们回来。当迈克将这个成果告诉萨吉时，他并未表现出多么沮丧，而是胸有成竹的保持着沉默。可汗特工来观察捷科的情况，因为他毕竟还是个病人，没想到捷科突然起身，口中喷出通红的火苗，几乎将密室的门都能烧化。可汗急忙呼叫救援，迈克和黛西赶忙过去，将化身为火龙的捷科迅速制服。　　基特森星球上，血腥的游戏正在进行，眼看菲兹和西蒙斯就要人头落地了，洋洋得意的基特森先生腰间突然多了一把匕首，一位名叫艾泽尔的女人逼迫基特森马上结束这场游戏，爱钱如命的基特森说结束游戏自己就会损失一大笔钱，艾泽尔让他留下地球人，杀死那个惯犯，并且愿意补偿他释放菲兹和西蒙斯的损失。基特森先生同意了这种交换，菲兹和西蒙斯才躲过了一劫。原来，艾泽尔要去往地球，但是她必须有地球人带队，而且她没有飞船，菲兹和西蒙斯听了异常高兴。而依诺克也完成了护送他们的任务，他要返回去拯救自己的长生星球和族人，于是，菲兹和他不舍的告别。　　梅特工他们抓到了那两个尖叫鸟，但是将他们关到密闭舱里的时候，意外发生了，两个尖叫鸟的声音振聋发聩，快要把和龙一号吵翻了，而且，两只鸟的宿主身上瞬间就长满了恐怖的尖刺，迅速刺破了舱门，眼看就要穿透整个舱体了，梅紧急向总部呼救。迈克只好叫来萨吉询问处理办法，但是萨吉趁机提出了自己的条件，那就是返还他的卡车和他们的自由。万分紧急的情况下，迈克只得答应了太多条件，萨吉说这种寄生鸟惧怕低温，可以往高处飞一些冷冻掉他们。得到指令的梅迅速拉起了船体，万米高空之外，那些怪异恐怖的尖锐物果然纷纷碎落了。萨吉得意的朝迈克举起了带着手扣的双手。$$$菲兹帮艾泽尔找到飞船 萨吉的目标是追杀艾泽尔　　菲兹帮助艾泽尔找到了可以飞回地球的飞船，但是需要他整个的检修一下。西蒙斯担心的问他，修好的把握有多大，菲兹说必须想办法，不然就会继续漂泊在太空，远离家乡数光年。　　神盾局基地里，经过一番讨价还价，为了地球的安全，迈克答应了萨吉的要求，但是他却没有将他的团队完全交给萨吉，而是安排梅，黛西和迪克上了萨吉的卡车，将萨吉的手下帕克斯和大块头捷科扣留下来，因为他不会完全相信萨吉的。　　菲兹接通了飞船的通讯系统，这样他们就有可能和地球保持联系了。而艾泽尔则觉得这样没有必要，她只是希望尽快赶往地球，去寻找属于自己的器物——蒂亚利，那是一种可以产生能量的神奇宝贝。可是它丢失了，之前她得知是被长生星球掠走了，等她赶过去的时候，长生星已经毁灭了。　　黛西坐在驾驶室里监督萨吉，攀谈中，萨吉告诉她，他们行进的目的是去到死亡黑塔，那里集中了数以百计的尖叫鸟宿主，他们集中爆发长出的怪异尖刺迅速延伸，他们要去阻止它不断的增长，如果它增长到目前的十倍之后，就会刺破地球表面层，引起地球爆炸。而制造这一切的，是一个叫艾泽尔的女人，而她马上就要到了。他们必须杀了她，才能结束这恐怖的一切。　　在行进的飞船上，艾泽尔告诉菲兹，他们这一次旅行充满危险，有一个人一直在追杀她。因为她知道那个人的所有底细，他想杀人灭口。和风一号作为神盾局的活动基地，跟踪在萨吉的卡车后面。迈克和悠悠也谈到了艾泽尔，因为博士的报告里提到印加神话中就有艾泽尔的故事。　　帕克斯得知他们一直跟着萨吉的卡车，就大喊迈克上当了。他打晕了守卫和捷科团聚，准备想办法冲出去，悠悠及时赶到，迅速制服了他们。但是帕克斯却说，他们真的面临危险。　　卡车上，梅和黛西忽然想起来很长时间没有见到迪克了，就去后仓找他，竟然看到了迪克正在和雪花做爱。萨吉知道后过来教训了迪克，被梅和黛西劝住，帕克斯说的不错，萨吉确实有阴谋，他已经在车上装置了炸弹，而且开启了卡车的自动驾驶模式，然后他迅速的借助高科技离开了卡车。　　得知他们在一辆无法停驶的卡车上，车上还有一颗不知道在哪里的当量惊人的炸弹，而且正在向死亡黑塔行进，迪克不禁大声叫骂起来。迈克也收到了他们的信息，现在只希望他们能尽快找到炸弹。最终，迪克终于找到了炸弹，而萨吉已经神不知鬼不觉的穿越到了和风一号上，见到了自己的队员。　　伊诺克联系上了之前的朋友艾萨亚，他所在的莱纳特星球情况还算正常，依然是以粪便做烹饪原料。伊诺克拜托他研制长生星球如何复原的方法。而长生人却因为伊诺克的背叛正在想办法抓捕他。$$$飞船被炸危机化解 神盾局特工们欢聚一堂　　迈克接到报告，一辆大型不明飞行物正在接近地球，迈克急忙安排启动昆式战斗机起飞准备战斗。而卡车上的危机仍然没有被排除，迈克分析，如果萨吉还在卡车上，他不可能自寻死路陪着一起殉葬，这里面一定出了问题。话说不及，萨吉就已经持枪带着捷科冲了进来，他们将迈克做为人质，劫持了和风一号。　　卡车上，只剩三分钟就要到达死亡黑塔了，可是迪克仍然没有找到如何拆除炸弹 听了雪花的描述，黛西知道这颗炸弹是太空核弹。已经没有时间了，车上的人准备好了与卡车同归于尽。黛西还是不愿意放弃，她启动自身的能量全力护住炸弹。卡车风驰电掣的闯入死亡黑塔，顷刻间，那些怪异恐怖的尖刺被冲击成碎片土崩瓦解。而卡车却安然无恙，车上的人有惊无险的躲过了这一劫。　　和风一号上萨吉得知炸弹未能爆炸，不觉有些慌乱。而此时飞船上，因为死亡黑塔的摧毁，艾泽尔找不到了降落目标，她要求菲兹赶快与地面联系，了解到底发生了什么。菲兹经过尝试和戴维斯联系上了，听到彼此的声音，他们互相都很激动。得知艾泽尔就在这条飞船上，萨吉情绪激动，他一定要追杀到她，因为是艾泽尔杀死了自己的家人，害的他一无所有。艾泽尔得知自己的制造的死亡黑塔已经不复存在，就命令菲兹拉升飞船返回外大气层。萨吉一看她要逃走，就气急败坏的命令戴维斯全力追击上去。　　趁着萨吉心浮气躁，迈克迅速反击，制服了他，而此时，悠悠也通过耐心的劝说，感化了大块头捷科。迈克决定乘坐昆式战斗机赶上飞船。而飞船上，菲兹和西蒙斯因为和地面联系中，有萨吉的声音，而被艾泽尔当成了叛徒，她带着手下在飞船上追杀两人，而其他人都已经感染上了艾泽尔制造的病毒，整条飞船都已经变成了一个巨大的感染源。　　地面上，更多的尖叫鸟围着卡车想侵入进去 ，梅指导大家赶快堵上一切门窗，但是，尖叫鸟拍击窗体的声音越来越大，眼看就要被撞破了。黛西做出了一个大胆的决定，堵不如疏，干脆打开车门，让那些鸟飞进来，用正能量来中和消除那些负能量。果然，正义的力量更加强大，那些负能量的鸟飞进来之后，瞬间就灰飞烟灭了。　　菲兹带着西蒙斯东躲西藏，危急时刻迈克带人赶到，顾不上表达团聚的喜悦，他们又一起去解救梅和黛西，而大块头捷科，则彻底认清了萨吉的自私和邪恶，他拿起了核炸弹，用他们自己的方式来到了飞船上，然后喷出火龙，将自己和飞船在空中一起化为灰烬了。　　一切危险消除了，神盾局的队员们团聚在一起，大家喝酒庆祝，迈克举起酒杯说道，敬那些爱岗敬业的人，敬那些为了他人牺牲自己的人，没有他们就没有神盾局。晚上，迈克来到悠悠的房间，他笨嘴拙舌的表达着自己对悠悠的爱恋和喜欢，他看悠悠对自己的表白并未表现出多么的激动，就落寞的说了晚安转身离开，悠悠抓住了他的手说或许他们可以试着开始。迈克听了后转身惊喜的抱住了悠悠。　　而梅却愤恨的抓起了枪，冲向被关押起来的萨吉，她不允许萨吉再顶着一张她深爱的人的脸在自己面前晃悠。$$$艾泽尔附身特工 萨吉最终未能杀死艾泽尔　　愤怒的梅冲进羁押萨吉的牢房，对着他愤恨的扣动了扳机，一连四枪直射在萨吉身上，枪声惊动了神盾局里的所有人。西蒙斯和菲兹紧急送萨吉去医院抢救。悠悠和黛西则留下来质问梅，她为什么会对已经失去没有任何反抗能力的萨吉，梅并未觉得这样做有什么不妥，于是梅被关押起来了。但是冷静下来分析的黛西和悠悠却觉得这事太过蹊跷，因为，梅从来不使用枪。想到此，黛西他们又去找梅了解情况，没想到梅一脸困惑的反问他们为什么要把自己关起来，自己什么都不记得了。　　梅的反常让悠悠和黛西意识到了情况的严重性：刚才做出那样疯狂举动的根本就不是梅，很有可能是艾泽尔附身了。迈克听到这个消息，意识到问题的复杂，也许此刻艾泽尔就已经附上了他们中的任何一个人身上，为了相互验证身份，他们每个人都说出了只有他们内部才知道的秘密。但是艾泽尔是动态的，她已经开始在每个人身上来回穿梭般的转悠，如果她附身自身功夫强大的特工，将会造成极大的危害，于是，迈克果断的将黛西和悠悠关了起来，以免艾泽尔对她们两个染指。　　被紧急送往医院的萨吉非但没有生命危险，而且身上的伤口也痊愈的完好无缺，这让菲兹和西蒙斯十分惊讶，菲兹分析了萨吉和科尔森前世今生，发现科尔森是在巨石炸毁之后死去的，而之后萨吉就出现了，艾泽尔也不断的寻找巨石蒂亚利，说明这一切都和巨石有关，是巨石爆炸时释放的能量造就了萨吉，并合成了科尔森的外形和DNA。　　艾泽尔附身了戴维斯，她纵身一跃从高高的天台上跳下，当即就被摔死了，众人痛苦不已。为了阻止悲剧的再次发生，迈克答应艾泽尔可以附身自己，因为他的权力和能量最大，更能帮助她做想做的一切。附身迈克的艾泽尔带着迈克离开大家，她专门要了守卫的手扣扣住了自己，并且跟着迈克来找能量球，她要拿走这个能够制造能力的球体。为此，她不惜让迈克用头部猛击大门，最终迈克晕厥倒地，而艾泽尔则轻而易举的拿到了自己想要的。　　悠悠和黛西反应过来。两人急忙展示超速度赶过来，在门口见到了晕倒在地的迈克。而拿到能量球的艾泽尔面露笑意，满足的转身要走，从病房里逃出束缚的萨吉举枪在身后对准了她，他终于和自己追了数个光年，无数个星球的仇人见面了，他恨她杀了自己的家人并且拿走了自己的回忆，让他每次想起那些支离破碎的回忆就会痛苦万分。艾泽尔说，这些都不是真的，那些回忆都不属于萨吉。萨吉不听她的对着她开枪射击，可是艾泽尔却完好无损，她告诉萨吉，他们是一样的材质构造，子弹根本伤害不了他们。　　艾泽尔还告诉萨吉，他之前那些记忆根本不是他的经历，他也不属任何家庭，萨吉和她之间没有仇恨，为什么两人一直纠缠不休，不过是因为他们都是一个光年的人，她这次见他，就是想唤醒他和自己一起回归。萨吉听了感到更加痛苦，他不相信自己苦苦追杀的仇人原来是自己的同类，他为此陷入了更大的烦恼之中。$$$艾泽尔劫持了本森博士 黛西用真情感化萨吉　　艾泽尔对萨吉一番洗脑之后，带着重力球离开，留下了痛苦纠结的萨吉。追来的悠悠遇到迈克后，留下来照顾他，他被艾泽尔附身后近乎自残的行为让他受伤很重。而艾泽尔并没有放过他们两个，而是在他两人身上来回穿梭，不断让两人互相折磨，听到两人对话中无意说出了本森博士知道她需要的存在于印加神话中的神庙的位置，艾泽尔立即附身迈克，以局长的名义命令本森博士前来，而迈克本人对此毫无办法阻止。　　毫不知情的本森博士带着助手兴奋的来见迈克，迈克无法说出实情，艾泽尔则凶残的当面杀掉了本森博士的助手，逼他为自己效力。找到神庙艾泽尔要准备进行某种意义的仪式，就有可能将罪恶的负能量无限量的释放，那些尖叫鸟就会出来制造数以万计的宿主来感染整个地球。被关起来的迈克和悠悠无力阻止这一切的发生，但是他们也理解本森博士的无奈，毕竟艾泽尔是一个无法沟通而且残忍的怪物。　　萨吉自从见到艾泽尔后性情大变，梅去劝说他改邪归正，想请他说出和科尔森相关的一切，但是他激动的暴跳如雷，谈话无法进行下去。菲兹和西蒙斯还有迪克 正在紧张的研究萨吉的前世今生，还有如何能控制住艾泽尔像猴子一样在他们每个人身上跳来跳去。他们发现萨吉身上的确有科尔森太多的生活痕迹，他身上的人性也逐步的被唤醒。至于对付艾泽尔，迪克发现了一种金属发出来的声音能够对她进行干扰。于是，他们抓紧开始研制对付艾泽尔的武器。　　黛西想起在卡车上萨吉曾经说过，要用一把剑去杀死艾泽尔，她就带着那把剑来找萨吉，她之前一直视科尔森为自己的父亲，对他敬爱有加，此时她以情动人，侃侃而谈诉说对科尔森和已故父亲的思念，渐渐的她发现萨吉不再那么凌厉，他的咆哮也有些色厉内荏，不再咄咄逼人。黛西满含热泪的拥抱了他，萨吉并未表现出太多的排斥。　　剩余的长生人发生了内讧，因为不同意建造新的长生星三号，阿塔拉被手下的猎人杀死。猎人下达了再寻找新的行动目标的命令。终于，本森博士带着艾泽尔他们找到了已经空无一人的神庙，悠悠和迈克被艾泽尔绑在神庙的柱子上，迈克看着拾级而上的艾泽尔，戏谑她将要进行的仪式太过冷清，艾泽尔却让他看往台下，一个少年黑人正站在那里。$$$黛西组织营救迈克和悠悠 萨吉用剑杀了梅特工　　迈克看到了弗林特，他是悠悠和自己用意念召唤过来的，想利用他身上的能量和艾泽尔抗衡。然而面对强大的艾泽尔，弱小的弗林特显得不堪一击，他被艾泽尔的能量推翻到地上久久不能站起来。艾泽尔已经开始用意念召唤援兵，她发出指令后，一支以数以万计的僵尸组成的部队迅速的向神庙集结，艾泽尔马上就要找到三块巨石，然后打开罪恶之门了。　　黛西他们决定去营救迈克和悠悠，目前萨吉的状态似乎很让人放心，他身上善的一面被逐渐唤醒，目前他应该是杀死艾泽尔最好的人选。她们找到了那支传说可以杀死太空之鬼的宝剑交给了萨吉。萨吉的匕首也被铸造成了为数不多的子弹，用来对付那些可恶的尖叫鸟。为了防备艾泽尔在他们任何人身上附体，菲兹和迪克在不断的争吵中研制成功了一种声频绝缘器，就这样，一切对付艾泽尔的工作都准备就绪了。　　昆式战斗机已经被艾泽尔劫持，黛西和梅他们目前只能驾驶和风一号赶到神庙。神庙里，在悠悠和迈克的呼唤下，弗林特艰难的站起来，他爬上高高的台阶为悠悠和迈克打开了手扣，却不料悠悠又被艾泽尔附身，亲手用自己的机械手打碎了弗林特浑身的骨头，悠悠为此万分痛心。　　看到昆式战斗机后，黛西和梅决定兵分两路，黛西先行引开大批僵尸，而萨吉和梅则正面朝神庙逼近 。一路上，梅和萨吉相互掩护，躲开了无数个僵尸的袭击，梅越发相信，眼前这个人就是科尔森，只不过他是一时被迷失了本性。基地里，迪克又实验成功了跳跃引擎，他背上之后瞬间就到达了神庙里，并迅速掩护迈克和悠悠带着弗林特逃出神庙。　　此时，艾泽尔正在施法，她调动全身意念和力量将三块巨石移动到指定位置，她要用它们来打开通往未来世界的大门，为此，不惜毁灭和牺牲一个又一个星球。迈克和悠悠将弗林特送上和风一号，把他交给派铂，让她赶紧返航救治好他，而他们又接着返回神庙，遇到黛西后得知她们竟然将危险的萨吉也带了来，迈克严厉的批评了黛西。　　黛西辩驳萨吉现在已经回归人性，迈克指责她过于天真，不由得担心起和萨吉一起的梅的命运。迪克被一群僵尸追赶，他却发现自己跳跃失败了，赶忙拿起对讲机和菲兹联系，菲兹告诉他，跳跃引擎需要充电，让他赶紧往昆式战斗机那里集结。此刻，艾泽尔穿上华丽的长袍，正在唱着一种古老的咒语，这个对她来说十分庄严的仪式结束后，她马上就可以成功了。萨吉阻止了梅准备对艾泽尔的刺杀，他要亲自杀死艾泽尔。　　艾泽尔见到萨吉后，开始了对他的洗脑，喋喋不休的话语像魔咒一样驱散了刚刚占据萨吉心头的善意，梅看出了他的犹豫，便也对他循循善诱，但是，最终萨吉还是将那支利剑插入了梅的胸膛。目睹这一切的艾泽尔露出了满意的微笑。伊诺克和萨特亚见面，他想通过他寻找专家拯救自己的母星，没想到遭到了萨特亚的突然袭击。$$$梅最终杀死了罪恶昭著的艾泽尔 依诺克帮助菲兹重新复原了神盾局基地　　菲兹和西蒙斯在控制中心远程监控到了萨吉将梅杀死的过程，他们悲愤的将这一消息报告给了被困在神庙里的迈克和黛西，黛西痛苦自责的向迈克道歉，毕竟是她力主将萨吉带来的，本以为萨吉已经转恶向善，没想到却害死了自己的战友梅。　　菲兹忽然联系不上他们了，接着整个系统出现了紊乱，正在诧异之间，长生人玛拉基带着武器冲了进来，原来是他们袭击了神盾局总部。神盾局的所有人都被赶了出来，长生人想占据地球建立长生星3号，而按照他们的理解，神盾局是他们这一理想的最大障碍。菲兹急忙将所有人都安排到迪克的秘密研发中心21楼，那是迪克盗窃神盾局科技秘密的地方，为此菲兹还曾经和迪克发生了激烈的争吵，力主让他取缔了。现在看来这派上用场了。　　迪克被僵尸人追杀，他躲进了昆式战斗机但是却不会驾驶，迈克就远程指挥他进行操作，目前他们被分割在两处，着十分不利于下一步的战斗，必须要合二为一才行。菲兹发现长生人竟然袭击了平时不为人知的可汗护卫队，才知道这是他们在太空时，长生人曾经把他和西蒙斯关进精神监狱，入侵过他们的大脑，所以知道他们所有的秘密。　　看到萨吉杀了梅，艾泽尔对萨吉称赞有加，他们一起弹冠相庆，只要三个人拿着石块启动程序，他们马上就可以打通神庙，迎来他们共同的族人，然后拥有地球人的皮囊，占领他们的灵魂，一切都要按照自己的意愿实现了。艾泽尔对萨吉表现出了浓厚的兴趣，而萨吉却依然仇恨填膺，并未接受艾泽尔的爱抚。此时，三个黑衣人正将三块石头嵌入机关，艾泽尔的阴谋马上就要得逞了。梅从血泊里醒来，她艰难的站起身，从石门里看到外面如潮水般涌来的那些魂魄，他们就要通过神庙，从地球人身上找到新的宿主来寄生了。　　正在高兴的艾泽尔忽然看到三块用来启动的小石块扔在她面前，便意识到事情有些不妙了。在于僵尸和尖叫鸟的搏斗中，一只尖叫鸟飞进了悠悠的嘴里，陷入痛苦中的悠悠请求黛西到最后时刻要帮准自己了结生命，黛西眼含泪水的答应了。迪克终于启动了昆式战斗机和他们团聚了。艾泽尔拿起了战刀去找梅决斗，两人迅速打斗在一起，最终还是梅战胜了艾泽尔，但是她却得意的说自己不需要战胜梅，因为自己已经完成了使命，她的愿望就要实现了。　　菲兹和西蒙斯决心毁掉基地，因为如果长生人掌握了再多的秘密，将会给地球带来更大的威胁。正当他们准备与基地同归于尽的时候，依诺克出现了，他现在是长生猎人萨塔亚的外表，所以菲兹没有及时的认出他。萨吉忽然变身怪鸟，将黛西和迈克都打到在地，现在他身上的能量已经无人能够控制了。艾泽尔也准备在身后袭击黛西，梅在后面一刀结果了艾泽尔，而迈克也接住了梅扔过来的那把斩杀太空鬼的利剑，将不可一世的萨吉拦腰斩断。　　做完这一切，众人都累的奄奄一息，悠悠经过痛苦的挣扎和自我折磨，终于吐出了那支只尖叫鸟。菲兹和西蒙斯赶来的时候，看到大家倒在地上东倒西歪。她让特工将梅抬上了飞船，将在零下55度的温度下对梅进行器官修复。然后她招呼大家坐上了和风一号，经过系统重装的和风一号更加智能和快捷，面对迈克的疑惑，西蒙斯直言是依诺克帮助了他们。此刻，飞船已经飞驶在纽约上空，面对激动的大家，西蒙斯说，神盾局需要一个熟悉神盾局历史的元老级人物加入。她的话音未落，画面上就出现了科尔森英俊和善的脸庞，他面带微笑的和大家打着招呼……　　（第六季全剧终）